台中辦事處設置沿革：

1. 本辦事處前身於日據時代為「台灣總督府農商局食糧部台中事務所」。
2. 台灣光復後，于三十四年十二月經政府接收，三十五年一月四日改制為「台灣省糧食局台中事務所」。
3. 五十五年七月改制為「台灣省糧食局台中管理處」。
4. 六十八年七月改制為「台灣省政府糧食局台中管理處」。
5. 民國八十八年七月一日依台灣省政府功能業務組織調整暫行條例第五條第二項規定改制為「行政院農業委員會中區糧食管理處台中辦事處」，隸屬「行政院農業委員會中區糧食管理處」，掌理台中縣（市）糧食生產、儲運、糧價調查、肥料運銷等糧政業務。
6. 九十三年一月三十日改制為「農委會農糧署中區分署台中辦事處」
   

南投辦事處設置沿革：

1. 日據時代「台灣總督府農商局食糧部台中事務所」於台中清水地區設有「清水出張所」，台灣光復後，于三十四年十二月經政府接收，三十五年一月四日改制為「台灣省糧食局台中事務所清水分所」。
2. 配合縣市新行政區域調整，裁撤「台灣省糧食局台中事務所清水分所」，並於 四十二年三月一日在南投設立「台灣省糧食局台中事務所南投分所」為本辦事處前身。
3. 五十五年七月改制為「台灣省糧食局台中管理處南投分處」。
4. 六十八年七月改制，分處升格為「台灣省政府糧食局南投管理處」。
5. 民國八十八年七月一日依台灣省政府功能業務組織調整暫行條例第五條第二項規定改制為「行政院農業委員會中區糧食管理處南投辦事處」，隸屬「行政院農業委員會中區糧食管理處」，掌理南投縣糧食生產、儲運、糧價調查、肥料運銷等糧政業務。
6. 九十三年二月一日改制為「農委會農糧署中區分署南投辦事處」，於九十三年八月裁撤 。